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刘永鑫的博客——宏基因组公众号

生物信息学-宏基因组学方向

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转载 限时删!一款干翻Sci-Hub的文献下载工具!

写论文的科研人到底有多难?不如来看看大家的现身说法:@某应用数学硕士:看论文——改论文——投论文——改论文——投论文……¥#@&*#Y¥@某分析化学博士:做实验——看文献——做实验...

2021-06-18 07:00:00 8

转载 EM: 生而为菌,自强不息-嗜酸杆菌在重金属污染土壤中的生态适应性机制

宏基因组分析揭示了重金属污染土壤中嗜酸杆菌纲菌的代谢潜力Metabolic potentials of members of the class Acidobacteriia in met...

2021-06-17 07:00:00 18 1

原创 宏基因组数据提交GSA指南

GSA简介GSA是Genome Sequence Archive的缩写,即基因组序列存档,由中科院基因组所主办。网址:http://gsa.big.ac.cn/之前介绍过NCBI提交测序数...

2021-06-16 07:00:00 14

转载 这个Venn 网络很漂亮!3分钟带你绘制!

再来3分钟看看EVenn的主要功能访问网址:http://www.ehbio.com/test/venn猜你喜欢10000+:菌群分析宝宝与猫狗梅毒狂想曲 提DNA发NatureCe...

2021-06-16 07:00:00 22

转载 连续发表三篇NAR的数据库文章——数据库承建

生物信息分析离不开数据资源和数据库,生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库。下面再分析3个我们承建的NAR发表的新数据库,以飨读者。中医药方剂的数据库,收录方剂、药材...

2021-06-15 07:00:00 18

原创 NBT:牛瘤胃微生物组的4941个宏基因组组装基因组(MAG)

牛瘤胃微生物组的参考基因组集用于瘤胃微生物组生物学和酶发现的4,941个瘤胃宏基因组组装基因组集Compendium of 4,941 rumen metagenome-assembled...

2021-06-15 07:00:00 35

转载 Nature子刊评论:2020年后,微生物组将如何发展?

本文转自肠道产业,链接 https://mp.weixin.qq.com/s/zMV6xugLHRcKwHTTM_SpLQ编者按:去过十年中,微生物组领域快速发展,产生了大量的数据。这些数...

2021-06-14 07:00:00 56

转载 Microbiome:浙大马忠华团队-生防细菌抑制病原真菌新机制

浙大农学院马忠华教授团队在Microbiome上发表论文揭示生防细菌抑制病原真菌新机制2021年6月7日,国际知名微生物学期刊Microbiome在线发表了农学院马忠华团队题为“Post-...

2021-06-13 07:00:00 26

转载 Microbiome:微生物所刘双江组建立人肠道微生物资源库(hGMB)

转自微科盟,原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/sC6G41jMEWyd0odQ18nDPw导读在肠道微生物组学研究中,培养的肠道微生物资源起着至关重要的作用,...

2021-06-12 07:00:00 130

转载 通知:招200名高层次人才!提供专业雅思培训,扫码进!

告诉大家一个好消息,2021雅思学习培训终于对外开放啦~上市公司高途决定公开招募200人,进行雅思口语+写作培训!小班授课,不设门槛,只要你感兴趣,现在报名就能加入!由高途讲师耗时6个月打...

2021-06-12 07:00:00 12

转载 Microbiome:城环所杨军组-小幅盐度变化改变了城市水库微型真核浮游生物群落的构建过程和网络稳定性...

全球内陆淡水水体盐度普遍正处于上升阶段,这种现象被称为淡水盐碱化综合征。模拟预测,未来淡水盐碱化将逐渐成为全球面临的首要生态环境挑战之一。淡水盐碱化会影响饮用水资源和破坏基础设施,例如管道...

2021-06-11 07:00:00 27

转载 天昊Accu16S细菌绝对定量测序项目登陆顶级环境杂志《Journal of Hazardous Materials》...

“昊”文章期刊名: Journal of Hazardous Materials使用技术:微生物Accu16STM细菌绝对定量测序近期,国际顶级环境科学类学术期刊《Journal of H...

2021-06-11 07:00:00 16

转载 招聘 | ​浙江农林大学孙学鹏团队招聘事业编制科研人员

一、课题组简介:孙学鹏博士,浙江农林大学园艺基因组学与分子育种研究团队负责人。2015年博士毕业于浙江大学,随后进入康奈尔大学Boyce Thompson研究所从事博士后研究。2021年3...

2021-06-10 07:00:00 30

转载 环境DNA高通量测序问题及解决SOP (Part 1: From sample to data)

高通量测序技术是对传统测序的革命性改变,基于扩增子的高通量DNA测序方法是目前国际上微生物群落研究中最方便、最经济、最有效的常规方法之一。然而不同研究会产生不同的结果,这通常是基于DNA序...

2021-06-10 07:00:00 29

原创 R包animalcules-一键式交互探索微生物组数据

写在前面这个包最优雅的地方在于交互式,所以学习的主要目的也就是交互式的实践。交互图可以很好的探索数据,但一般不支持输出矢量图,不方便下游编辑和修改和用于发表。如果你找到了导出矢量图方法,请...

2021-06-09 07:00:00 46

转载 中农王金锋组诚聘微生物组学方向博士后

课题组诚聘微生物组学/生物信息学方向博士后中国农业大学食品科学与营养工程学院王金锋课题组,主要通过生物组学与食品营养学科的交叉融合,开展“消化道菌群与人体代谢”、“营养组学与健康维护”、“...

2021-06-08 07:00:00 23

转载 中科院基因组所高远组诚聘生物信息学方向助理/副研及博士

中科院北京基因组研究所高远课题组中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)国家基因组科学数据中心高远课题组因科研工作需要,现公开招聘计算及实验生物学方向助理/副研究员3名及特别研究助理...

2021-06-08 07:00:00 38

转载 985硕博导师:如果你没空看书,我强烈建议你做这件事

昨天在微博上看到一个网友的投稿:研三了,我经常陷入自我怀疑,感觉就是骑虎难下。句句扎心,路过的研究僧们都在评论里抱团宣泄。考研难,读研难,毕业后更难!刚入学时,很多人被导师的光环所吸引。然...

2021-06-08 07:00:00 72

转载 增强版在线LEFSe分析和可视化鉴定标志性基因或物种

LEfSe分析即LDA Effect Size分析,是一种用于发现和解释高维度数据 生物标识(基因、通路和分类单元等)的分析工具,可以进行两个或多个分组的比较,它强调统计意义和生物相关性,...

2021-06-07 07:00:00 75

原创 MPB:农科院牧医所赵圣国组-厌氧微生物培养基制备与培养方法

为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量,本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅...

2021-06-06 07:00:00 37

转载 The Innovation | Call for Youth Editors 青年编委招募

“The Innovation” launched in May 2020 and rigorously follows the same peer review, editorial, ...

2021-06-05 07:00:00 80

原创 MPB:地大郭东毅等-一种针对重金属污染土壤的高效DNA提取方法

为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量,本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅...

2021-06-05 07:00:00 39

转载 mSystems和Microbiology Spectrum杂志“肠道微生态专题”论文征稿

美国微生物学会(American Society for Microbiology,ASM)是生命科学领域中全球最大且历史最悠久的会员组织,创办了多个高影响力学术期刊。目前会员超过 300...

2021-06-04 12:00:00 89

转载 The Innovation | Volume 2 Issue 2 正式出版

Volume 2 Issue 22021年05月28日The Innovation第二卷第二期正式出版封面解读Earth, our home, covered by 70% water a...

2021-06-02 07:00:00 40

转载 Medicine in Microecology:母婴微生物组专刊征稿(陈廷涛、王金锋)

SpecialIssue "Maternal and infant microbiome" Dysbiosis has been shown to be widespre...

2021-06-01 07:00:00 39

转载 The Innovation | 直接病原学证据:无症状患者可引起COVID-19传播

导 读世界依然笼罩在COVID-19(新冠肺炎)大流行的阴影中。有限的流行病学调查显示,无症状患者可引起SARS-CoV-2(新冠病毒)传播,从而成为疫情防控中的薄弱环节。但受限于调查覆盖...

2021-06-01 07:00:00 25

转载 JGG:COVID-19感染导致儿童上呼吸道和肠道菌群持续失衡

2021年5月29日,JGG在线发表了复旦大学附属上海市公共卫生临床中心张驰宇教授、云南大学张志刚研究员和复旦大学附属儿科医院徐锦研究员题为“Progressive deteriorati...

2021-05-31 07:00:00 22

转载 Nature Protocols | 密歇根州立大学何胜阳/Tiedje团队建立拟南芥微生物组研究的标准化生长体系!...

多细胞生物体与栖息在其身体各部位的各种微生物群落不断接触。这些微生物统称为微生物群,在宿主的健康和疾病中发挥着关键作用(Nature Microbiology | 微生物组创新,实现可持续...

2021-05-31 07:00:00 47

原创 Water Research:南土所褚海燕组揭示冰川源水体和沉积物细菌群落显著分异

Water Research: 中科院南京土壤所褚海燕组揭示冰川源水体和沉积物细菌群落显著分异冰川源高寒河流共存水体和沉积物细菌群落环境驱动机制显著不同Co-existing water ...

2021-05-30 07:00:00 199

转载 NC:电缆细菌减少水稻种植土壤中的甲烷排放

摘要 甲烷是仅次于二氧化碳的第二大温室气体,全球约11%的人为甲烷排放来自稻田。硫酸盐施用是一种减少稻田甲烷排放的减缓战略,因为硫酸盐还原剂和产甲烷菌争夺相同的底物。已...

2021-05-30 07:00:00 43

转载 高颜值免费在线绘图工具迁移完成~~~

已完成迁移,大部分工具可用,欢迎大家测试反馈问题、提出新功能http://www.ehbio.com/Cloud_Platform/front/#/操作视频:https://www.bil...

2021-05-29 07:00:00 66

转载 FungalTraits: 超越FUNGuild的最新真菌表型数据库

Link:https://link.springer.com/article/10.1007/s13225-020-00466-2Journal: Fungal Diversity基于F...

2021-05-29 07:00:00 78

原创 Nature子刊:三代测序重构菌株水平宏基因组序列的计算框架iGDA

https://doi.org/10.1038/s41467-021-23289-42021年5月24日,美国西奈山伊坎医学院冯智星等在Nature Communications发文题为D...

2021-05-28 07:00:00 51

原创 MPB:农科院牧医所赵圣国组-基于GraftM对功能基因进行物种注释

为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量,本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅...

2021-05-27 07:00:00 30

转载 Nature子刊:刘威/潘玉峰等发现肠道微生物可以影响果蝇的攻击行为

https://doi.org/10.1038/s41467-021-23041-y2021年5月,湖北大学,山西医科大学,东南大学等多单位合作,刘威及潘玉峰(湖北大学为第一单位)共同通讯...

2021-05-27 07:00:00 55

转载 华岩资本--微生物领域项目投递通道

华岩资本--微生物领域项目投递通道·‖·华岩资本创投(CRCMVenture Capital)是华岩资本的风险投资业务部,并有超过10年出色的跨境投资早期技术创业公司记录,专注于...

2021-05-26 07:00:00 32

原创 MPB:沈阳生态所李琪组-​土壤线虫群落DNA提取、扩增及高通量测序

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2021-05-26 07:00:00 102

原创 MPB:农科院牧医所赵圣国组-微生物超高分子量DNA提取方法

为进一步提高《微生物组实验手册》稿件质量,本项目新增大众评审环节。文章在通过同行评审后,采用公众号推送方式分享全文,任何人均可在线提交修改意见。公众号格式显示略有问题,建议电脑端点击文末阅...

2021-05-25 07:00:00 22

转载 “昊论坛”热力来袭!一网打尽【微生物绝对定量】技术特色和应用

昊论坛话题√本次直播会议将为大家详尽介绍Accu16STM及AccuITSTM两大产品的技术特色、分析方法及应用优势;√同时我们还特别邀请了近期利用Accu16STM细菌绝对定量技术发...

2021-05-25 07:00:00 25

转载 ​纽约伊坎医学院房刚组诚聘博士后: 表观基因组, 宏基因组, 精准医疗

纽约伊坎医学院房刚组诚聘博士后: 表观基因组, 宏基因组, 精准医疗实验室介绍美国西奈山伊坎医学院(Icahn School of Medicine at Mount Sinai, US ...

2021-05-24 07:00:00 28

Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)

Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909),可下载后解压,替换Windows中R语包安装目录,如我的文档,R,win-libarary,4.0

2020-09-09

刘永鑫Adam的留言板

发表于 2020-01-02 最后回复 2020-08-23

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