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刘永鑫的博客——宏基因组公众号

生物信息学-宏基因组学方向

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转载 做科研发论文一直找不到研究热点?硕博导师都在关注的平台你还不快来?

科研学习过程中,及时关注学界动态,高效获取优质资源,对我们非常重要。下面这 6 个公众号经常发布优质信息(比如研究前沿、论文发表等),非常适合本科生、硕博生们去学习,就连导师们都在关注。...

2019-12-31 07:00:00 133

转载 Fungal Diversity:70位作者共同修订真菌界担子菌门分类系统

担子菌门 (Basidiomycota R.T. Moore 1980)真菌是以食药用菌为代表的大型真菌最主要构成,也包括植物病原菌锈菌和黑粉菌,还有酵母菌等,其物种数占真菌界1/3,四...

2019-12-31 07:00:00 204

原创 COM:病原体之外-微生物组与植物免疫系统的相互作用

文章目录病原菌之外:微生物组与植物免疫系统的相互作用Beyond pathogens: microbiota interactions with the plant immune system划重点背景植物免疫系统影响微生物组装配图1. MAMP的常规模式和微生物用来逃避植物免疫系统的潜在机制微生物组用于逃避或抑制植物免疫的策略MAMP序列变异MAMP降解和隔离MAMP修饰图2. 微生物组扩展了植...

2019-12-30 08:56:23 1952 1

原创 COM:微生物促进植物的氮获得

文章目录微生物植物关联促进植物的氮获得划重点摘要前言通过菌根获得氮图1 通过微生物联合获取氮根系微生物群有助于氮营养与根相关的共生内生固氮菌的生物固氮结论微生物植物关联促进植物的氮获得Microbial associations enabling nitrogen acquisition in plantsCurrent Opinion in Microbiology [6.916]20...

2019-12-29 20:50:46 1529

原创 COM:细菌-真菌的平衡维持动植物健康

文章目录细菌-真菌的平衡维持动植物健康划重点摘要前言植物和动物生态位中细菌和真菌群落的变化图1.动植物生态位中的优势细菌和真菌类群的组成和变化动植物生态位中的细菌-真菌共生图2.细菌-真菌失衡是动植物疾病的潜在原因宿主疾病中细菌-真菌平衡的改变结语相关阅读:细菌-真菌的平衡维持动植物健康Contribution of bacterial-fungal balance to plant and...

2019-12-29 17:19:36 1038 1

转载 生物领域预印本bioRxiv发展概览

撰文 | 雪月责编 | 兮2019年11月6日,bioRxiv发表了一篇题为“bioRxiv: the preprint server for biology”的文章,介绍了bioRx...

2019-12-29 07:02:00 295

原创 微生物组-扩增子16S分析研讨会(1月已爆满,最早要等4月)

在广大粉丝的期待下,《生信宝典》联合《宏基因组》在2020年4月10-12日北京推出《扩增子16S分析》专题培训第七期,为大家提供一条走进生信大门的捷径、为同行提供一个扩增子分析实战学习...

2019-12-29 07:02:00 283

转载 经常流鼻血不是上火,可能是寄生水蛭钻进了你的鼻腔

一位男子经常流鼻血,原本以为是上火但这种情况已经连续10天了。于是,他决定前往医院进行检查。不曾想,医生从他的鼻孔里发现了一个活的水蛭。根据医生的判断,这个水蛭至少起码在那里生活了两周。...

2019-12-28 07:00:00 119

转载 Microbiome:扩增子16S分析苏铁类植物微生物组

植物微生物组被称为植物的第二或者扩展基因组,能给宿主提供丰富的氮磷等营养元素,促进植物生长,提高抗性,对植物适应不良环境具有重要贡献。苏铁类植物是现存最为古老的种子植物,保留了一些适应干...

2019-12-27 09:01:14 103

原创 今年1篇Science,2篇NBT,2篇MP,1篇PNAS等11篇文章,遗传发育所白洋组在植物微生物组取得系列进展!

文章目录今年1篇Science,2篇NBT,2篇MP,1篇PNAS等11篇文章,遗传发育所白洋组在植物微生物组取得系列进展!Science:拟南芥根系三萜化合物塑造特异的微生物组NBT封面:水稻NRT1.1B基因调控根系微生物组参与氮利用NBT:微生物组分析流程QIIME 2MP:微生物跨界平衡维持植物健康MP:植物微生物组国际交叉学科研讨会:微生物组与植物健康PNAS:植物香豆素塑造拟南芥合成根...

2019-12-26 13:38:39 1133

转载 高级转录组分析和R数据可视化

封面来源:https://www.zhihu.com/question/304747766常规转录组是我们最常接触到的一种高通量测序数据类型,其实验方法成熟,花费较低,是大部分CNS必备...

2019-12-26 07:00:00 691

转载 Science:细菌和古菌多重抗性系统抵御噬菌体和外来质粒

作者:李婷婷,南京农业大学硕士在读,主要研究根际噬菌体疗法本期为您介绍细菌和古菌针对噬菌体和质粒进化出的除已知抗性系统之外的多重抗性系统。原文于2018年发表于Science。摘要细菌和...

2019-12-25 07:00:00 369

转载 “单词不用背,看完自然会”,4天背过1万单词,原来学英语真的有捷径!

前天,Coco突然找到我,说要请我吃饭。我准备辞职了,上周我成功通过500强的英语面试,拿到了运营推广经理的Offer,工资是现在的6倍!没有您教我学英语,我不可能在3个月内提升得这么快...

2019-12-25 07:00:00 314

转载 2019年度巨献:肠道微生物组研究领域重要成果解读!

文章转自生物谷时光总是匆匆易逝,转眼间,2019年就要结束了,在即将过去的一年里,科学家们在肠道微生物组研究领域取得了哪些重要的研究成果呢?本文中,小编对相关重要的研究成果进行整理,分享...

2019-12-23 07:00:00 597

转载 中科院SCI期刊分区(又称JCR期刊分区)知多少

SCI期刊常用的评价指标是IF。考虑到IF指标是洋指标,中国科研工作者进一步根据国情设立了中科院JCR期刊分区表来对期刊的管理进行补充。中科院期刊分区其实就是把所有的期刊按照一定指标划分...

2019-12-22 08:27:44 1147

转载 SCI-HUB客户端(文献神器V6.0)——下载文献如此简单

SCI-HUB网站简介如何简洁而优雅的下载文献?SCI-HUB是最常用文献下载网站,其数据库包括了近亿篇免费文献,能满足99%的论文需求;其用户分布在全球各个国家,中国用户数量最多,其次...

2019-12-21 00:01:50 675

转载 Cell综述:动植物界的微生物群和宿主营养

作者:张潞潞,南京农业大学硕士在读,主要研究益生元配合有机肥防控土传病害。周刊主要展示LorMe团队成员优秀周报,每周定期为您奉上学术盛宴!本期周刊为您介绍动植物界的微生物群和宿主营养之...

2019-12-20 00:00:00 248

转载 Cell Research:华农解析水虻基因组图谱和肠道微生物组降解规律

近日,华中农业大学生命科学技术学院张吉斌教授课题组与上海植物生理研究所黄勇平研究员课题组合作,对武汉亮斑扁角水虻纯化10代的品系进行了全基因组测序,获得了高质量水虻基因组图谱,并对水虻转...

2019-12-19 07:00:00 179

转载 EST:李芳柏团队揭示微生物介导的砷氧化耦合硝酸还原

近日,广东省生态环境技术研究所李芳柏研究员团队与华南师范大学环境学院李晓敏教授合作,在国际环境科学领域顶级期刊Environmental Science & Technology...

2019-12-19 07:00:00 247

转载 Science:综述肠道菌群如何影响社交行为

编译| 咸姐责编 | 兮社交包括一系列复杂的互动行为,可以是合作的、中立的,也可以是对立的。社交可以促进互利的结果,如劳动分工、合作照顾和提高免疫力,当然社交也可以导致消极的结果,包括侵...

2019-12-18 07:00:00 255

转载 CHM:植物利用细菌获得真菌抗性!中山大学李剑峰课题组揭示植物免疫预警新机制...

细菌和真菌是共存于自然界的两类主要植物致病菌。总体来说,植物周边的细菌数量远多于真菌【1】,而真菌对植物的危害则要甚于细菌【2】。古老的壶菌门真菌已经能够侵染海洋中陆地植物的祖先——藻类...

2019-12-16 07:00:00 370

原创 Microbiome:城环所杨军组揭示随机过程主导亚热带河流微型真核浮游生物群落构建

文章目录Microbiome: 随机过程主导亚热带河流微型真核浮游生物群落构建新闻稿引言结果与讨论结论:通讯作者简介Reference猜你喜欢写在后面Microbiome: 随机过程主导亚热带河流微型真核浮游生物群落构建【题目】Stochastic processes shape microeukaryotic community assembly in a subtropical rive...

2019-12-15 10:40:39 902

转载 人类吃屎用屎指南:用做肥料不如制咖啡、当展品、做炸弹

公元前一万年,大概一亿人生存在地球上,他们产生的5500万公斤人类粪便分散在世界各地,缓慢地喂食其他生物。或者说,被其他生物利用。到了2013年,地球上有70亿人口,人类的排泄物总产量接...

2019-12-15 07:20:00 208

转载 关于肠道菌群研究的7大事实和5大倡议

联署发起人赵立平、杨瑞馥、张发明、王军、马永慧、蓝灿辉、李丹宜、张素贞、许晓曦、沈通一、郎秋蕾、姜泊、张美玲、钱晓国、王欣、李英、王保红、肖传兴、魏玮、姜长涛、曾建国、宁康、段丽萍、朱书...

2019-12-14 07:00:00 850

转载 大多数人都不知道,人类基因组正在衰败

本文由《万物》杂志官方微信“把科学带回家”提供本文转载自公众号“把科学带回家”(ID:steamforkids)过去的致命疾病在现代社会不再致死,人类因此摆脱了自然选择,但也为此付出...

2019-12-14 07:00:00 150

转载 Mol Plant |中科院微生物所郭惠珊组和中科院上海植物逆境中心段成国组合作揭示油菜生长与免疫动态调节的新机制...

2019年11月30日,Molecular Plant杂志在线发表了中科院微生物所郭惠珊课题组与中科院上海植物逆境中心(中科院分子植物科学卓越创新中心)段成国课题组合作完成的题为“A B...

2019-12-13 07:00:00 185

转载 7天精通AI、PS、GraphPad Prism等软件,轻松制作各种高分SCI杂志插图!

全文概要:为了帮助广大科研人员更高效地掌握SCI论文插图制作和统计分析作图软件的使用,我们定于1月04-10日在首都医科大学举办7天上完3门课程(《SCI论文插图绘制》(3天)、《SCI...

2019-12-13 07:00:00 473

原创 Microbiome:土壤微生物驱动退耕还林系统土壤剖面的养分循环

主编按:焦硕博士早年发表的《SBB-2016-石油污染土壤微生物群落构建与生物多样性研究》相当经典,我们又约了焦博士近期发表于《Microbiome上关于退耕还林土壤剖面养分循环研究》的...

2019-12-13 07:00:00 177

原创 Microbiome:环境过滤驱动农田生态系统土壤古菌独特的空间分布

主编按:大家还记得焦硕博士吧,2018年末在平台邀请下分享了其在《Microbiome:土壤微生物驱动退耕还林系统土壤剖面的养分循环》和《SBB:石油污染土壤微生物群落构建与生物多样性研...

2019-12-13 07:00:00 161

转载 Ecology&Evolution|微生物功能多样性从概念到应用

DOI:https://doi.org/10.1002/ece3.5670Journal: Ecology and EvolutionIF: 2.415Publishedonline ...

2019-12-12 07:00:00 603

转载 NBT:利用细胞甘油三酯存储提高链霉菌中聚酮类化合物的效价

利用细胞内甘油三酯存储提高链霉菌中聚酮类化合物的效价靶向代谢流分析(Glycosis, TCAcycle, beta-oxidation)由中科脂典平台完成原文链接: https://w...

2019-12-11 07:00:00 563

转载 最终版本Science级组合图表绘制

简介ggcor 是厚哥最近的作品,功能完全代替了science组合图表绘制。这里我也为大家带力实战教程,总体来说厚哥这个ggcor包用起来还是挺方便的,将许多功能简化,为我们提供了一个很...

2019-12-10 06:53:41 945 2

转载 青岛能源所提出微生物组相似度新算法DMS

自然界中,微生物组(亦称“菌群”)无所不在,其结构深刻体现着生态系统的健康状态,因此微生物组结构比对是菌群检测服务于精准健康、精准护理与精准营养的核心环节之一。青岛能源所单细胞中心提出了...

2019-12-09 00:00:00 231

转载 小麦的一生矢量图收藏贴-从种子的萌发到完熟

近日,堪萨斯州立大学农学院Romulo Lollato教授绘制的小麦生长发育图,小麦研究联盟公众号的朋友对原图进行了翻译和排版,现在分享给大家,感谢原创作者及编译人员,文末附高清图片下载...

2019-12-08 07:00:00 185

原创 子宫日记Womb

写在前面周末科普时间又到了,可惜我还在加班。带比大家一部优秀的科普视频,非常适合和孩子一起看。每家的孩子都会经常问,我从那里来的。我家的孩子5岁,自己看了此片后,还跟我讲解:”这就是小时...

2019-12-08 07:00:00 858

原创 走进科学-小菌株大作为—枯草芽孢杆菌替代畜牧业抗生素添加

我国是世界上最大的抗生素生产和使用国,同时也是细菌耐药性的重灾区。抗生素滥用问题在医疗特别是畜牧业领域尤其严重。畜牧业养殖户普遍将饲用抗生素添加到饲料中,当做保健品给动物防病,促进动物生...

2019-12-08 07:00:00 138

转载 上个世纪中国就宣布已消灭的可怕传染病,如今又卷土重来了

梅毒,可以说是最让人难以启齿的疾病之一。然而,解放前梅毒就曾在大江南北广泛肆虐。为此,新中国成立后不久就掀起了一场浩浩荡荡的消灭梅毒运动。皇天不负苦心人,1964年我国就宣布基本消灭了梅...

2019-12-08 07:00:00 101

原创 再造人类生命的神奇细胞Human.Life.Our.Amazing.Cell

点击上方蓝色「宏基因组」关注我们!专业干货每日推送!本周继续向大家推荐日本NHK的另一部良心之作《再造人类生命的神奇细胞》,更侧重要介绍我们的成长发育过程,和探索衰老的原因,而且还是日本...

2019-12-07 07:00:00 146

原创 最好的肠道菌群科普记录片

史上最详细肠道菌群科普,科学网精华文章影片信息日文名:腸内フローラ解明!驚異の細菌パワー中文名:肠道细菌 / 肠道花园类型:医療健康时长:49min官网:http://www.nhk.o...

2019-12-07 07:00:00 407

转载 R语言可视化学习笔记之ggridges包

作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源。严涛老师的绘图教程还有:gganimate |诺奖文章里面的动图绘制教程来了!!ggplot2学...

2019-12-06 07:00:00 718

Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909)

Windows系统R语言4.0安装包合集(20200909),可下载后解压,替换Windows中R语包安装目录,如我的文档,R,win-libarary,4.0

2020-09-09

刘永鑫Adam的留言板

发表于 2020-01-02 最后回复 2020-08-23

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